La description, même brève, de la végétation de la Madonie, ne peut être complète sans une note sur la flore endémique et les plantes rares qui se développent dans cet étonnant univers de verdure.
On parle d’un patrimoine riche et précieux d’une flore qui comprend des espèces uniques et rare aux niveaux régional et national. Certaines de ces plantes avec leur floraison embellissent déjà les magnifiques paysages de la Madonie.

Parmi les plantes rares et endémiques, on trouve – outre les genêts de Cumpani citée un peu plus haut – l’Astragale des Nebrodi, présente avec ses magnifiques pétales au-dessus des 1 200 m dans des habitats extrêmes.
La Violette Nebrodensis, avec sa belle inflorescence pourpre constelle les pentes du Pizzo Carbonara.
La pivoine, aux belles fleurs rouges ou blanches de mars à juin, est présente dans cette plaine de montagne.
Et encore le Lin sicilien (Stipa sicilienne), une exclusivité unique du Monte Quacella, réputé pour sa souplesse ; la Stellina di Gussone (Asperula gussonei) rare et à la belle inflorescence rosée qui se trouve dans les habitats de calcaire dolomitique et en haute altitude ; l’Aubrezia sicilianna (Aubrieta deltoidea) aux petites inflorescences rose-violet, parmi les plus rares et les plus endémiques à la Madonie ; le trèfle de Bivona-Bernardi (Trifolim bivonae), endémique à la Sicile et à la belle inflorescence rouge ; le Spillone Nebrodensis (Armeria nebrodensis) le Chardon neigeux (Ptilostemon niveus), une rareté sicilio-calabraise. L’Astro Sorrentino (Sorrente Aster), un bel exemple de Composita, récemment découvert entre Polizzi, Castelana et Petralie.
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